Сюжет аниме разворачивается вокруг молодого принца Арслана, наследника королевства Парс. Его отец, правитель Андрагорас, известен как сильный и решительный монарх. Арслан с детства сомневается в своей способности соответствовать ожиданиям, связанным с его происхождением и статусом. В королевстве назревает политический конфликт, который перерастает в масштабное военное столкновение. В ходе битвы Арслан замечает признаки заговора, направленного против его отца. Король Андрагорас терпит поражение

В будущем Япония столкнулась с катастрофой, вызванной экспериментами по созданию искусственных организмов. Один из опытов привел к инциденту, названному Взрывом. В результате утечки субстанции Материя произошло неконтролируемое событие, охватившее Куробское ущелье. Город, считавшийся научным центром, был поглощен субстанцией и превратился в закрытую опасную зону по распоряжению правительства. Через два года пятнадцатилетняя Айко Татибана, потерявшая семью во время этой трагедии, узнает, что ее