Кирито и Асуна оказываются вовлечены в инцидент на секретной базе, где тестируется система "Алисизация". Происходит нападение на объект, что создает угрозу для всего онлайн-проекта "Underworld". Персонажи начинают выяснять, кто стоит за атакой. В ходе расследования устанавливается, что нападение организовала преступная группировка, целью которой является получение программного кода. Злоумышленники планируют использовать код в собственных интересах. Кирито осознает, что

Такамине занимает пост президента студенческого совета в первый год старшей школы. Она демонстрирует высокие результаты в учебе и спорте. У Такамине есть способность возвращаться в прошлое и изменять события. Для активации этой способности ей необходимо снять часть одежды. После получения низкой оценки на тесте Такамине решает использовать свою способность. Во время урока она начинает раздеваться, игнорируя реакцию одноклассников. Ее одноклассник Широта становится свидетелем этого поступка.

Сюжет второго сезона разворачивается вокруг переродившегося Верховного Бога, который ставит перед собой новую цель - стать императором. В прошлом этот бог обладал значительной властью и вызывал страх у других божеств. Однако его погубило предательство со стороны возлюбленной женщины. После гибели главный герой не мог переродиться в течение ста лет. Будучи Верховным Богом, он не способен полностью умереть, поэтому его душа сохранилась. Душа бога возродилась в новом мире, хотя на этот процесс

Люди случайно обнаружили Бездну, которая стала объектом интенсивного изучения. В это место прибывают исследователи, стремящиеся найти ответы на вопросы, а также получить выгоду или известность. Существует множество легенд о Бездне, но точных сведений о ее внутреннем устройстве нет. По слухам, внутри обитают существа, питающиеся человеческой плотью и кровью, и неосторожность может привести к гибели. Однако это не останавливает искателей сокровищ, которые рискуют жизнями, спускаясь в это место.